با توجه به مصوبه شورای گسترش دانشگاه های علوم پزشکی، این اساسنامه در ۹ ماده و یک تبصره به تصویب رسید.
ماده ۱)به منظور گسترش پژوهش و ارائه راه حل در امور بهداشتی درمانی و به موجب این اساسنامه مرکز تحقیقات ناباروری که در این اساسنامه مرکز تحقیقات نامیده می شود برای تامین اهداف زیر مورد موافقت اصولی قرار گرفت. 
ماده۲ ) اهداف

۱- توسعه و به کارگیری دانش بشری در زمینه علم

۲- انجام پژوهش های بنیادی اپیدمیولوژیک و بالینی در جهت اصلاح نظر ارائه خدمات بهداشتی درمانی کشور به منظور جوابگویی به نیازهای جامعه اسلامی

۳- جمع آوری، تنظیم و طبقه بندی اسناد، مقالات و مدارک مربوطه و انتشار آنها

۴- تربیت نیروی انسانی محقق در زمینه

۵- ترغیب تشویق و بکارگیری محققین

۶- کوشش درجلب توجه و همکاری مراکز تحقیقاتی و اجرائی مربوطه در داخل کشور

۷- همکاری علمی با مراکز تحقیقاتی و آموزشی سایر کشورها و سازمان های بین‌المللی با رعایت قوانین و مقررات دولت جمهوری اسلامی ایران

ماده۳ ) ارکان مراکز عبارتند از

الف) شورای عالی

ب ) رئیس مرکز

ماده۴ ) اعضاء شورای عالی مرکز عبارتند از

۱- رئیس دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی

۲- معاون پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی

۳- معاون امور بهداشتی دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی

۴- رئیس مرکز

۵- سه نفر از اعضاء هیات علمی مرکز با پیشنهاد رئیس مرکز و تأیید رئیس دانشگاه

ماده۵ وظایف شورای عالی مرکز به شرح زیر می باشد

 ۱- تصویب خط مشی پژوهشی مرکز

 ۲- تصویب طرحهای همکاری با سایر دانشگاه ها و مؤسسات آموزشی پژوهشی داخلی و خارج از کشور و سازمان های بین المللی مطابق مقررات و ضوابط مربوطه

 ۳- بررسی و تصویب گزارش سالانه فعالیت های مرکز

 ۴- بررسی و تصویب و بودجه سالانه مرکز درمحدوده اعتبارات تخصیصی و با رعایت ضوابط قانونی

 ۵- تصویب دستورالعمل های مربوط به امور داخلی شورایعالی و دستورالعمل های اجرایی مرکز تحقیقات

 ۶- پیشنهاد سازمان و تشکیلات مرکز

 تبصره : مصوبات شورایعالی مرکز براساس سیاست ها و خط مشی ها و هماهنگی با وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی خواهد بود.

ماده۶ ) رئیس مرکز به پیشنهاد شورایعالی مرکز و حکم رئیس دانشگاه علوم پزشکی هر چهارسال یک بار منصوب می گردد و انتخاب مجدد، و بلامانع است .

ماده۷ ) وظایف رئیس مرکز

رئیس مرکز بالاترین مقام اجرائی مرکز است و در حدود ضوابط قانونی و مصوبات شورای عالی جهت اجرای وظایف و امور محوله اقدام می نماید.

ماده۸  اعضاء مرکز: مرکز دارای دو نوع عضو به شرح زیر است :

 الف) اعضاء پیوسته : که اعضاء هیئت علمی و کارشناسان تمام وقت مرکز هستند.

 ب ) اعضاء وابسته : که اعضاء هیئت علمی سایر گروه های دانشگاه علوم پزشکی و یا سایر دانشگاه ها و مؤسسات آموزش عالی هستند.

ماده۹ ) منابع مالی مرکز 

 الف) درآمدهای حاصله از خدمات مرکز طبق ضوابط قانونی

 ب) کمک و هدایای اشخاص حقیقی و حقوقی

 ج) اعتبارات دولتی در صورت تخصیص